游戏特色
最终版本5.0EX的最大亮点在于剧情、对战与美工3个方面。
剧情方面极具创意，在保留口袋妖怪的世界观的基础上，引入了平行世界的概念，包含游戏世界Genera，漫画世界Creatio和动画世界Abando，游戏流程达三个周目，新增了包括二周目新大陆——赛诺地区在内的大量全新的地图，极大提高了游戏的可玩性，包括全部历代冠军及反派首领在内的诸多人气角色以及一些原创角色都在剧情流程中登场。
对战方面新增了大量截止到第五世代的新特性和新技能，物理、特殊按照第四世代后的方法划分，拥有相对比较完善的对战体系，并强化了原本的游戏难度，也新增了很多丰富的挑战要素。
美工方面以后时代的官方版本为标准，美化了大量素材，相较于原版绿宝石有较大进步。
另外值得一提的是，该版本在技能动画方面的修改即使放到世界范围也是首屈一指的。
口袋妖怪漆黑的魅影神兽捕捉攻略
1、水君：
从128号水路冲浪到彩幽市，瀑布下面有个小洞，进入后可以遇到水君，40级。
2、雷公：
紫堇市往下走，冲浪到新紫堇(需要在打败父亲千里道馆后，再去找铁旋拿到新紫堇钥匙)，进入后往上走。进入神之领域后，遇到雷公，40级。
3、炎帝：
来到热焰小径，在打败釜炎镇道馆后，可以使用技能怪力术，用怪力推开热焰小径里左边的大石头。在深处看到一个洞，门口可以捡到技能机器猛毒素。进入洞穴后遇到炎帝，40级。此外，在热焰小径另一边可以找到火之石。
4、闪电鸟：
来到流星瀑布深处，同样看到一个洞穴进入，遇到闪电鸟，40级。
5、急冻鸟：
从113号道路洞口进入寒冰小径，需要怪力推动右边挡路的石头，进入寒冰小径深处的洞穴，遇到急冻鸟，40级。
6、火焰鸟：
在冠军之路第二层，会看到一个洞穴，需要使用怪力和碎岩，进入后遇到火焰鸟，40级。
二周目神兽捕捉：
(以下需要在打赢丰缘地区四天王和冠军侯才能捕获)
1、凤王、洛奇亚
飞去绿萌镇，进入卡绿隧道，从隧道下方的小洞冲浪出来。在这里瀑布攀瀑上去，进入神之领域。再攀瀑上去后，有两个洞穴，进入左边洞穴可以捕捉风王，右边可以捕捉洛奇亚。左侧洞穴，凤王，70级。右侧洞穴，洛奇亚，70级。
在凯那市的港口找到库斯诺吉馆长，可以从深海之牙和深海之鳞中二选一(珍珠贝进化用)。
2、超梦
飞去武斗镇，进入石之洞窟，先前被大石头挡住的路可以进入了。和里面的男子对话，回答他的问题选择“否”，他会交给你破坏因子。飞往茵郁市，向右走到120号道路，冲浪进入洞穴。来到洞穴深处，遇到超梦，80级。捕获后，先前的男子又出现了，交代主角好好照顾超梦。
3、拉帝欧斯、拉迪亚斯
去凯那市，坐船，上传后遇到亚希达，他会告诉主角对战开拓区的事，主角便可以前往南方小岛。进入2号船舱，休息一下就到了水静市。下船后，再上船，就可以前往南方小岛，来到岛深处，触摸装置，出现的神兽与是你之前看电视选的颜色相反的。另外一只会在全地图上随机遇到。
口袋妖怪漆黑的魅影属性克制
攻击类属性分为普通、地、岩、钢、毒、虫、幽灵、飞、格斗。特攻分为超能、火、水、草、冰、龙、恶、电。游戏攻击类属性总共有17种
1、普通克无，弱点格斗，抵抗无，无视幽灵。举例说明：小拉达是普通系，你用格斗招式打它，效果翻倍。如果你用幽灵招打它(如影球)，打它就没有效果。
2、地面克岩、毒、格斗、火、电，弱点是水、草、冰，抵抗岩、毒，无视，电。
3、岩克虫、飞、火，弱点是地、钢、格斗、水、草、冰，抵抗普通、飞、火。
4、钢克岩、虫。弱点是格斗、火，抵抗普通、岩、钢、虫、幽灵、飞、超能、草、冰、龙、恶，无视毒。
5、毒克草，弱点是地、超能，抵抗毒、虫、草。
6、虫克超能、草、恶，弱点是岩、钢、飞、火，抵抗地、虫、草。
7、幽灵克幽灵、超能，弱点是幽灵、恶，抵抗无，无视普通、格斗。
8、飞行克虫、格斗、草，弱点是岩、冰、电，抵抗格斗、虫、草，无视地面。
9、格斗克普通、岩、钢、冰、恶，弱点是地、飞、超能，抵抗恶。
10、超能克毒、格斗，弱点是虫、幽灵、恶，抵抗格斗、超能。
11、火克钢、虫、草、冰，弱点是地、岩、水，抵抗钢、火、草、冰。
12、水克地、岩、火，弱点是草、电，抵抗钢、火、冰。
13、草克地、岩、水，弱点是毒、虫、飞、火、冰，抵抗地、水、草、电。
14、冰克地、岩、飞、草、龙，弱点是格斗、火，抵抗钢、冰。
15、龙克龙，弱点冰、龙，抵抗格斗、火、水、草、电。
16、恶克幽灵、超能，弱点虫、格斗，抵抗幽灵，无视超能。
17、电克飞、水，弱点地面，抵抗钢、飞、电。
以上介绍的口袋妖怪相克表只限于攻击招。使用本身属性的招式会有原先招式1.5倍的威力，使用非本身的招式则威力只有一倍。如喷火龙用火焰放射，招式威力是95加上属性的加成是142，而用劈斩则只有原先的70威力。
