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SnapGene 6中文破解版 v6.0.2

大小:42MB

时间:2022-01-20

类别:办公软件

系统:PC

立即下载没有对应的手机版,本软件为电脑版,电脑版软件不支持手机安装。
SnapGene是一款可计划、可视化和记录日常分子生物学程序的最简单的软件。自定义酶位点、特征、引物、ORF、DNA颜色等的显示。地图可以是圆形或线形格式。利用该软件高效的数据处理能力,扫描具有成千上万注释特征的大型DNA序列。进行插入、删除、替换和案例修改。当一个序列被复制和粘贴时,特征会自动转移。自动注释常见特征,或手动注释新的特征。利用SnapGene广泛的数据库在你的DNA序列中寻找常见的特征。您选择的其他特征可以被添加到自定义数据库中。它提供了优雅的、信息丰富的窗口来模拟各种常见的克隆和PCR方法。用粗体字突出独特的限制性位点,或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters 酶组。使用你自己的引物,或要求该应用程序自动设计引物。产品文件在其历史中储存了模板和引物。组装最多八个片段。选择要连接的片段和它们的方向,Snap Gene将设计引物。使用序列视图可以一目了然地看到两个翻译的特征是否在框架内。如果是,翻译就被连接在同一行。如果不是,翻译就在不同的行上。使用强大的对齐工具来检查一个实际的构造是否与模拟的构造相符。它自动记录操作以创建图形历史,并在最终文件中存储祖先结构。使用您熟悉的、安全的计算机操作系统来存储和组织您的Snap Gene文件。将一个序列导出为GenBank或FASTA格式。将图谱或模拟琼脂糖凝胶导出为常见的图像格式。将序列、图谱或凝胶图像转换为标准格式,以便与其他软件一起使用。信息的开放交流至关重要,因此该软件和SnapGene Viewer提供了读取和导出常见文件格式的选项。
SnapGene 6中文破解版 v6.0.2

安装教程

1、从本站下载数据包并解压,运行安装程序,设置安装目录然后点击next。

2、点击“i agree”。

3、选择需要的组件然后点击next。

4、点击install开始安装。

5、安装完成,

6、最后将破解补丁复制到安装目录下替换原文件即可

软件功能

1、设计更好的流程
准确地设计和模拟克隆过程。测试复杂方案、预防潜在错误,第一次就可获得正确构造。
提高准确性,同时加快进程,节约你的时间和金钱。
优雅、信息丰富的窗口,以模拟常见克隆和PCR方法
清晰的示意图,让你清楚地看到不同构造如何组合在一起
SnapGene通过持续跟踪DNA甲基化和磷酸化等细节,助你识别并规避常见失误

2、可视化你的流程
当你能看到你在做什么时,克隆会更加容易。直观的界面为你的工作提供了无与伦比的可视性,简化了通常较复杂的任务。
凭借无与伦比的可视性和操控性,即使是克隆新手也能快速应对复杂任务。
获得非凡的DNA及蛋白质序列的可视结果
创建和浏览带有丰富注释的质粒图,或扫描带有数千个注释特性的大型DNA序列
通过高度可视化的测序结果与模拟结构的比对,以确认克隆结果

3、自动记录你的工作
SnapGene自动化归档,让你无需为文档管理担忧。查看和分享每一个序列编辑和克隆程序,直至找到你的最终质粒。
模拟程序的自动化归档,助你节省更多时间,并让分享和保存工作更轻松、更高效、也更有效。
自动生成丰富的图形历史记录,轻松查看序列编辑和克隆程序
通过共享包含历史细节的完整结构,以增强协作、留存知识点
大胆尝试全面的“撤销”功能,追溯你的每一步

软件特征

1、分子克隆
限制性克隆
Gateway®克隆
Gibson Assembly®
NEBuilder HiFi组装
In-Fusion®克隆
TA and GC 克隆
TOPO®克隆
2、引物
设计引物
退火两个寡核苷酸以形成双链产物
3、引物
设计引物
退火两个寡核苷酸以形成双链产物
4、PCR和诱变
模拟PCR
重叠延伸PCR
引物定向诱变
5、酶组
酶组
预定义酶组 – 按群或切位
创建自定义酶组
查看酶的详细信息
对甲基化敏感性和相关错误预防提供多样支持
6、转换文件格式
Alignment Formats
ApE
CLC Bio
Clone Manager
DNA Strider
DNADynamo
DNASIS
DNAssist
DNASTAR Lasergene®
DS Gene
EMBL (ENA)
EnzymeX
GenBank / DDBJ
Gene Construction Kit®
Geneious
GeneTool
Genome Compiler
Jellyfish
MacVector
pDRAW32
Serial Cloner
Swiss-Prot
Vector NTI®
Visual Cloning
7、翻译
查看和编辑翻译后功能
开放性阅读框(ORFs)
完整序列翻译
检查基因融合框架
制作蛋白质(从DNA)
反向翻译(从蛋白质)
8、比对
将DNA序列与参考序列进行比对
验证克隆或突变
将cDNA与染色体比对
成对和多序列DNA和蛋白质比对
选择比对算法 - Clustal Omega, MAFFT, MUSCLE, T-Coffee
重叠群组装
9、可视化
多个视图下查看DNA序列
大序列支持 – 浏览染色体大小序列
编辑DNA和蛋白质序列
序列色码
10、历史记录
全面“撤销”功能
查看结果的图形历史
使用可选的历史颜色来识别序列中最近的更改
11、琼脂糖凝胶模拟
模拟琼脂糖凝胶
模拟限制酶切消化
模拟聚合酶链式反应扩增
大量收集MW标记
12、特性/注释
创建和编辑特性
常见特性自动注释
手动注释异常特性
选择其它密码子
特性转换的复杂编号
支持核糖体滑移
13、数据管理
从常用文件格式导入,包含注释和说明
导出标准格式
创建和共享集合
通过SnapGene Viewer共享数据
运行批处理操作
安全文件管理
寻找DNA或蛋白质序列
寻找酶、特性或引物
14、常规
跨平台兼容性 – Windows, macOS, Linux

软件优势

一、想象
1、DNA可视化
查看DNA序列的多个视图。
地图 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 历史
自定义酶位点,特征,引物,ORF,DNA颜色等的显示。地图可以是圆形或线性格式。
使用双链模式查看酶位点,具有翻译,引物和DNA颜色的特征。单链模式显示具有彩色特征的紧凑概览。
从一系列酶组中选择。剪切网站可以显示为数字或行,按名称或频率排序。
按名称,位置,大小,颜色,方向性或类型对带注释的要素列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。
按名称,长度,颜色,结合位点,方向性或解链温度对杂交引物列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。
查看DNA构建体的自动生成的图形历史记录。祖先序列可以作为单独的文件恢复
2、大序列支持
浏览染色体大小序列。
查看 · 搜索 · 缩放
利用SnapGene的高效数据处理功能,扫描具有数千种注释功能的大型DNA序列。
使用专有的MICA算法立即在染色体内找到序列。
使用多功能控件调整缩放系数和显示区域。
3、蛋白质可视化
查看蛋白质序列的多个视图。
地图 · 序列 · 属性 · 特征 · 历史
自定义区域,站点,键和序列颜色的显示。
使用具有相关特征的1-或3个字母的氨基酸代码查看蛋白质序列。
查看蛋白质的分子量,消光系数,等电点和氨基酸组成。可以对蛋白质的选定部分进行相同的分析。
按名称,位置,大小,颜色或类型对带注释的功能列表进行排序。复选框在紧凑或完全展开的显示之间切换。
查看自动生成的蛋白质序列图形历史记录。祖先蛋白质或DNA序列可以作为单独的文件再生。
4、直观的序列编辑
轻松编辑DNA和蛋白质序列。
标准编辑 · DNA结束
进行插入,删除,替换和大小写更改。复制并粘贴序列时,会自动传输功能。
编辑线性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯。
5、序列颜色编码
将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种颜色之一。
给两条DNA链或蛋白质序列着色。颜色在Map和Sequence视图中都可见。
6、特征注释
自动注释常用功能,或手动注释新功能。
自动特征检测 · 手动特征注释
使用该软件广泛的数据库查找DNA序列中的常见特征。您选择的其他功能可以添加到自定义数据库中。
选择DNA或蛋白质序列的一部分,并使用灵活的GenBank兼容控件注释特征。
二、模拟
1、限制性站点指标
确认限制性网站适合克隆。
独特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性质
以粗体显示独特的限制性位点,或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组。
不要被愚弄,因为限制性位点被Dam,Dcm或EcoKI甲基化阻断。该软件将自动用星号标记该站点。
利用工具提示来避免有问题的限制网站。
2、限制性克隆
可视化克隆过程的所有方面。
如果您已经考虑过程,则模拟只需几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷,则可以捕获并纠正错误。
3、PCR
模拟标准PCR。
使用您自己的引物,或要求SnapGene自动设计引物。产品文件在其历史记录中存储模板和引物。
4、重叠延伸PCR
通过重叠延伸PCR融合片段
最多可组装八个碎片。选择要连接的片段及其方向,该软件将设计引物。
5、引物定向诱变
使用诱变引物进行定点诱变。
选择诱变引物,按下按钮查看修饰的质粒。历史颜色突出了突变。
6、网关®克隆
模拟网关® BP克隆或LR克隆,或两者在同一时间。
为方便起见,提供了常见的供体向量和目的向量。选择要组装的片段,该软件将设计引物。
7、吉布森大会®
通过融合多达八个片段或通过将多达八个片段插入向量来模拟Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种流行的无缝克隆方法。
选择要融合的片段及其方向,该软件将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
8、IN-FUSION ®克隆
通过在向量中插入最多八个片段来模拟Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一种非常通用的方法,可用于创建无缝基因融合。
选择要融合的片段及其方向,该软件将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
9、TA和GC克隆
通过TA或GC克隆捕获PCR产物。
选择传统的TA克隆或高效GC克隆。
为方便起见,提供了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。
10、退火Oligos
退火两个寡核苷酸形成双链产物。
使用简单的控件添加突出限制克隆。
三、避免错误
使用该软件,确保构造符合您的要求,并确认您获得了所需的序列。
1、阅读基因融合的框架
确保构造中的已转换要素符合框架。
链接翻译 · 警告信息
使用“序列”视图可以快速查看两个已翻译的要素是否在框架中。如果是这样,翻译链接在同一行。如果不是,则翻译在单独的行上。
2、与参考序列对齐
使用强大的对齐工具检查实际构造是否与模拟构造匹配。
地图概述 · 序列详细信息
请参阅对齐序列与参考序列匹配的位置的概述,以及存在差异的位置。
四、自动录制
该软件自动记录操作以创建图形历史记录,并将祖先结构存储在最终文件中。
1、全面的“撤销”能力
几乎撤消任何操作。
不要害怕尝试使用SnapGene文件 - 回溯您的步骤很容易。
2、历史和嵌入式祖先
查看构造的图形历史记录。
单击操作以突出显示亲本和产物序列的相关部分,或单击PCR引物名称以查看引物序列。
单击历史记录树中的祖先以重新生成该祖先序列文件,包括其注释和克隆历史记录。
3、历史色彩
使用可选的历史记录颜色来标识序列的最新更改。
详细了解构建体的组装方式,包括结扎的粘性末端。
五、拥有你的数据
该软件允许您根据需要阅读和共享文件,同时保持对数据的完全控制。
1、安全文件管理
将该软件文件保存在所需的位置。
使用熟悉的安全操作系统来存储和整理该软件文件。
2、从其他格式导入
阅读许多常见的文件格式。
不仅可以导入DNA序列,还可以导入注释和注释。我们将继续开发进口商,以确保您不会被锁定为专有文件格式。
3、导出为标准格式
将序列,地图或凝胶图像转换为标准格式,以便与其他软件一起使用。
将序列导出为GenBank或FASTA格式。将地图或模拟琼脂糖凝胶导出为常见的图像格式。
4、使用SnapGene Viewer共享数据
将该软件格式的文件发送给可以下载免费该软件的同事或客户。
只需将文件与链接一起发送到该软件即可。收件人将能够看到地图,序列和注释,就像在完整的SnapGene界面中一样。
5、对于开发人员
要将该软件整合到您的数据分析或实验室管理软件中,请联系我们以获取有关如何读取和写入该软件文件的信息。
六、转换文件格式
开放式信息交换至关重要,因此该软件和该软件提供了读取和导出常见文件格式的选项。
从其他格式导入时,目标不仅是捕获DNA序列,还捕获注释和注释
新功能介绍
1、重叠群大会
线性或环状重叠群可以从重叠序列或Sanger序列迹线重新组装。
2、灵活的对齐
现在可以以各种方式导入要对齐的序列。可以提取多个对齐的一部分以生成新的多重对齐,或者可以编辑现有的多个对齐以添加或移除由不同算法生成的对齐。
3、Nicking Enzymes
可以显示Nicking核酸内切酶。当选择跨越从线性序列的末端到切口核酸内切酶位点时,可以通过按Delete删除该单链区域。
4、点特征
现在,DNA序列支持零长度点功能,并在从GenBank,MacVector或Gene Construction Kit导入文件时识别。
5、酶网站突出显示
常用的酶位点可以用黄金突出显示,以便快速识别。
6、协调一致性增强
多重比对的共识序列具有改进的格式,现在可以复制或导出。
7、用于与参考序列对齐的存储编辑
根据流行的需求,当通过调整比对序列的端点编辑与参考DNA序列的比对时,保留和恢复那些编辑。
8、从其他文件格式导入功能
可以将特征导入到BED,GFF3或GTF格式的DNA序列中。
9、从UniProt导入
可以从UniProt数据库导入蛋白质序列记录。
10、进口基因组编译器项目
现在可以在SnapGene中直接打开Genome Compiler项目文件(.gcproj)。对于施工项目文件,在“历史记录”视图中捕获施工历史。
11、引物添加日期
将引物添加到文件时,会记录日期。引物可按添加日期排序。
12、读取和写入对齐文件格式
该软件可以将对齐导入SAM / BAM和VectorNTI®.cep格式的参考序列,并可以将对齐导出为SAM / BAM格式的参考序列。
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